畜肉和魚肉由肌肉組織構(gòu)成，其主要成分為易變性的蛋白質(zhì)，夾雜由脂肪組織及1％的糖原，其余為水。畜肉中，長束狀圓柱狀纖維和結(jié)締組織一起構(gòu)成伸縮肌。魚肉組成和畜肉相似，只是纖維組成塊狀，各纖維塊之間是結(jié)締組織肌隔。因此，畜肉和魚肉中肌纖維的定向?qū)崃總鬟f和蒸汽傳遞十分重要。

肉類凍干時一般不允許連骨帶脂一起干燥，因為骨頭的干燥時間長，而脂肪組織在干燥時間長、干燥溫度高時就有可能融化，堵塞凍干層中的空穴，阻礙了蒸汽的傳遞。先將肉剔除脂肪，再沿垂直于肌纖維的方向切成薄片，使凍干時冰晶的升華界面的移動方向與肉的紋理一致，有利于傳熱傳質(zhì)，且有利于凍干制品的復水。

。在冰升華時，它會留下孔隙在干燥的剩余物質(zhì)里。這樣就保留了產(chǎn)品的生物和化學結(jié)構(gòu)及其活性的完整性。

冷凍干燥也應用于化學分析中，它能得到干燥態(tài)的樣品，或者濃縮樣品以增加分析敏感度。凍干使樣品成分穩(wěn)定，也不需改變化學組成，是理想的分析輔助手段。冷凍干燥可以自然發(fā)生。在自然情況下，這一過程緩慢而且不可預測。通過冷凍干燥系統(tǒng)，人們改進、細分了很多步驟，加速了這一過程